هزینه امور مربوط به ایندکس‌سازی در پروژه نمایه‌سازی تدبیرساز، بسیار پایین و پس از حصول نتیجه و نمایه مورد نظر دریافت می‌شود. در واقع هزینه‌های تمام شده برای مؤسسه، شاید بیشتر از مبلغی باشد که از مجلات دریافت می‌شود چرا که هدف از ارائه خدمات نمایه‌سازی به نشریات، درآمدزایی برای مؤسسه نیست بلکه به عنوان افتخار کاری در رزومه علمی تدبیرساز قلمداد می‌شود و به عنوان کمکی خیرخواهانه به جامعه علمی کشور و سهمی هر چند ناچیز در اعتلای جایگاه نشریات و دانشگاه‌های کشور در پایگاه‌های استنادی و جامعه علمی جهانی.
در زیر به هزینه برخی از خدمات نمایه سازی اشاره شده است :
- هزینه استانداردسازی : رایگان
- هزینه دواج : 5 میلیون تومان بعد از اخذ نهایی نمایه
- هزینه کووپ : 5 میلیون تومان بعد از اخذ نهایی نمایه
- هزینه شبکه‌های علمی نظیر گوگل اسکالر، آکادمیا : 2 میلیون تومان بعد از اخذ نهایی نمایه
- هزینه اسکوپوس: 15 میلیون تومان بعد از اخذ نهایی نمایه
- هزینه ISI WOS: معادل 25 میلیون تومان بعد از اخذ نهایی نمایه
- هزینه پابمد: معادل 25 میلیون تومان بعد از اخذ نهایی نمایه
- هزینه سایر نمایه‌های اختصاصی نظیر publon, prequest , و... 4 میلیون تومان بعد از اخذ نهایی نمایه